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      轉錄組測序-毛白楊
      行業新聞 2020-01-07

        2016年,10x Genomics公司推出ChromiumTM系統,這是一套分子條形碼和分析系統,由儀器、試劑盒和信息學軟件組成,能夠對接Illumina測序儀。

        木材形成影響木材的化學和物理性質,因此影響其作為建筑材料或生物燃料,紙漿和紙的原料的效用。為了獲得基因組范圍內對木材形成中轉錄組測序變化和調控網絡的見解,北京林業大學的研究人員使用高通量RNA測序來表征來自張力木(TW),木材(OW)和成熟木質部的成熟木質部的cDNA文庫。普通木材(NW),在工業樹種毛白楊(Populus tomentosa)中。

      轉錄組測序

        它們的測序產生140,978,316(TW),128,972,228(OW)和117,672,362(NW)讀數,對應于10,127(TW),10,129(OW)和10,129(NW)獨特基因。其中,361個基因在TW和OW之間差異轉錄(log2FC&ge;1或&le;-1,FDR<0.05),ow和nw之間差異為2,658,tw和nw之間差異為2,417。這表明nw與樹枝中的木材明顯不同; go="">

        基于不同基因的共表達模式,研究人員構建了兩個用于調節木質素和纖維素生物合成的轉錄組網絡,包括TF。他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因。表明不同木材類型的TF豐度差異顯著,可能在反應木材的形成中起重要作用。此外,與TW相比,參與木質素生物合成的大多數基因的轉錄物在OW中更豐富,這與OW的較高木質素含量一致。基于不同基因的共表達模式,研究人員構建了兩個用于調節木質素和纖維素生物合成的轉錄組網絡,包括TF。他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因。表明不同木材類型的TF豐度差異顯著,可能在反應木材的形成中起重要作用。

        此外,與TW相比,參與木質素生物合成的大多數基因的轉錄物在OW中更豐富,這與OW的較高木質素含量一致。基于不同基因的共表達模式,研究人員構建了兩個用于調節木質素和纖維素生物合成的轉錄組網絡,包括TF。他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因。基于不同基因的共表達模式,研究人員構建了兩個用于調節木質素和纖維素生物合成的轉錄組測序網絡,包括TF。他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因。基于不同基因的共表達模式,研究人員構建了兩個用于調節木質素和纖維素生物合成的轉錄組網絡,包括TF。他們使用逆轉錄定量PCR來驗證鑒定的差異表達基因。  

      轉錄組測序

        誠邀各大測序公司及技術服務公司一起合作,為單細胞測序的發展貢獻力量。有合作意向請撥打:021-57790908,郵箱:zhujianming0374@163.com

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