近期，Nature Methods發表了數篇關于大規模單細胞測序儀相關文章，包括文庫制備、測序方法、分析方法等，這里介紹其中的幾篇。

一：Scalable whole-genome single-cell library preparation without preamplification

文章介紹了直接文庫準備（DLP）方法，一種穩定、可擴展、高保真的方法。用納升體積的轉位反應制備單細胞全基因組文庫，不需要預擴增。文章檢測了782個細胞，結果表明，與現有方法相比，低深度測序顯示出更大的均一覆蓋度和更可靠的拷貝數變化。

二：Effective detection of variation in single-cell transcriptomes using MATQ-seq

文章報道了一種高靈敏度的單細胞測序儀總RNA定量測序方法，即利用多重退火和基于dC尾定量的單細胞RNA測序方法（MATQ-seq）。文章用該方法獲得了單細胞測序儀全轉錄組之間的生物學變異。

三：Sequencing thousands of single-cell genomes with combinatorial indexing

文章提出了單細胞測序儀胞組合標引測序方法（SCI-seq），同時產生成千上萬個單細胞文庫，檢測體細胞拷貝數變異。文章構建了16698個單細胞文庫，包括培養細胞系、靈長類前額皮質組織和兩個人類腺癌組織，并詳細分析了胰腺腫瘤亞克隆變異。

四：Single-cell mRNA quantification and differential analysis with Census

本文作者將人口普查算法引入RNA-seq數據分析，將相對RNA-seq表達水平轉換為相對轉錄量，而不需要加標對照。該方法能顯著提高準確度。

五：Massively multiplex single-cell Hi-C

該篇文章針對染色體的結構，提出了基于多重標引的單細胞測序儀Hi-C技術。